MOM - Modular Ocean Model - Historique des versions

Sennevil le 2 juin 2017 à 17:29

2017-06-02T17:29:53Z

Caveenj : 19 révisions importées

2017-06-01T18:49:14Z

19 révisions importées

Dumoda01 le 1 juin 2013 à 21:24

2013-06-01T21:24:29Z

Dumoda01 le 1 juin 2013 à 16:18

2013-06-01T16:18:41Z

Dumoda01 : /* Compiler le code */

2013-06-01T16:04:03Z

Compiler le code

Dumoda01 : /* Compiler le code */

2013-06-01T16:02:16Z

Compiler le code

Dumoda01 : /* Compiler le code */

2013-06-01T15:59:53Z

Compiler le code

Dumoda01 le 1 juin 2013 à 15:52

2013-06-01T15:52:31Z

Dumoda01 : /* Générer une grille */

2013-05-30T18:34:56Z

Générer une grille

Dumoda01 le 5 avril 2013 à 15:24

2013-04-05T15:24:28Z

← Version précédente		Version du 2 juin 2017 à 17:29
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	= Problèmes potentiels =		= Problèmes potentiels =
		+
		+
		+	[[Category:Modèles numériques]]

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   doc/        ! Documentation
   exp/        ! Contient les scripts d'exécution des différentes configurations possible
-  matlab/     ! Contient des scripts Matlab utile pour préparer ou transformer les entrées et sorties du modèle
+  matlab/     ! Scripts Matlab pour préparer les entrants du modèle
   src/        ! Code source

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 Vous êtes maintenant prêt à construire une expérience. Un bon point de départ pour cela est de suivre le guide démarrage rapide se trouvant dans <tt>doc/</tt>.
-Il est également conseillé de copier le contenu d'une expérience existante qui fonctionne dans votre nouveau répertoire et d'adapter le contenu des fichiers petit à petit.
+D'abord, vous devez créer un nouveau répertoire portant le nom de l'expérience. Une expérience est traditionnellement associée à une grille: lorsque qu'on change la grille, il est fortement suggéré de créer une nouvelle expérience.
 === Générer une grille ===
-MOM4p1 contient des outils de génération de grille qui permettent d'accommoder des simulations océanique seulement (<tt>solo</tt>) ou couplée (<tt>coupled</tt>) avec la glace et/ou l'atmosphère. Ces outils se trouvent dans le répertoire (<tt>src/preprocessing/generate_grids</tt>). Dans les deux cas, on commence par générer une grille océanique dans le répertoire (<tt>src/preprocessing/generate_grids/ocean</tt>). Cette étape est la plus cruciale et nécessitera certainement plusieurs ajustement. Pour faciliter ce processus itératif, il est important de suivre la convention de nomenclature fichiers qui est présentée ici et adoptée pour la suite. Le script de base qui compile les routines fortran de génération de grille et exécute le programme s'appelle <tt>ocean_grid_generator.csh</tt>.
+MOM4p1 contient des outils de génération de grille qui permettent d'accommoder des simulations océanique seulement (<tt>solo</tt>) ou couplée (<tt>coupled</tt>) avec la glace et/ou l'atmosphère. Ces outils se trouvent dans le répertoire (<tt>src/preprocessing/generate_grids</tt>). Dans les deux cas, on commence par générer une grille océanique dans le répertoire (<tt>src/preprocessing/generate_grids/ocean</tt>). Cette étape est la plus cruciale et nécessitera certainement plusieurs ajustements. Pour faciliter ce processus itératif, il est important de suivre la convention de nomenclature fichiers qui est présentée ici et qui est adoptée pour la suite. Le script de base qui compile les routines fortran de génération de grille et exécute le programme s'appelle <tt>ocean_grid_generator.csh</tt>.
 === Générer les forçages ===
 = Problèmes potentiels =

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   ./mom4p1_coupled_compile.csh
-Suite à la compilation du code, un nouveau répertoire aura été créé portant le nom <tt>exec_$platform</tt>, dans lequel se trouve un répertoire <tt>$type</tt> (<tt>mom4p1_coupled</tt> si vous avez compilé avec <tt>mom4p1_coupled_compile.csh</tt>). C'est dans ce répertoire que se trouve l'exécutable <tt>fms_$type.x</tt> (e.g. <tt>fms_mom4p1_coupled.x</tt>) ainsi que les produits de la compilation (*.o et *.mod).
+Suite à la compilation du code, un nouveau répertoire aura été créé portant le nom <tt>exec_$platform/$type</tt>, dans lequel se trouve un répertoire <tt>$type</tt> (e.g. <tt>exec_ifort11_LINUX/mom4p1_coupled</tt>). C'est dans ce répertoire que se trouve l'exécutable <tt>fms_$type.x</tt> (e.g. <tt>fms_mom4p1_coupled.x</tt>) ainsi que les produits de la compilation (<tt>*.o</tt> et <tt>*.mod</tt>).
 == Configurer une expérience ==

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   CM2.1p1_compile.csh         ! Compile le modèle couplé CM2.1p1
-Dans ces scripts, vous devez spécifier la variable <tt>platform</tt> réfère à l'extension des fichiers <tt>exp/environs.$platform</tt> et <tt>mkmf.template.$platform</tt>. Vous devez donc vous assurer que le contenu de ces fichiers correspondent bien à l'environnement de votre serveur. Si vous utilisez [[brandypot]], utilisez <tt>IFORT11_LINUX</tt>. Pour exécuter le modèle en parallèle sur plusieurs processeurs en mode mémoire distribuée spécifier <tt>MPI=1</tt>. Vous pouvez également choisir de compiler en allouant la mémoire de manière statique ou dynamique avec la variable <tt>static</tt>. En mode statique, vous devez alors spécifiez la taille des tableaux qui dépendra alors des dimensions de votre grille ainsi que du nombre et la taille des sous-domaines. Toutes les autres variables devraient en principe rester inchangées. Une fois le script modifié correctement, vous pouvez compiler en tapant l'une ou l'autre des commandes suivantes:
+Dans ces scripts, vous devez spécifier la variable <tt>platform</tt> réfère à l'extension des fichiers <tt>exp/environs.$platform</tt> et <tt>mkmf.template.$platform</tt>. Vous devez donc vous assurer que le contenu de ces fichiers correspondent bien à l'environnement de votre serveur. Si vous utilisez [[brandypot]], utilisez <tt>IFORT11_LINUX</tt>. Pour exécuter le modèle en parallèle sur plusieurs processeurs en mode mémoire distribuée spécifier <tt>MPI=1</tt>. Vous pouvez également choisir de compiler en allouant la mémoire de manière statique ou dynamique avec la variable <tt>static</tt>. En mode statique, vous devez alors spécifiez la taille des tableaux qui dépendra alors des dimensions de votre grille ainsi que du nombre et la taille des sous-domaines. Toutes les autres variables devraient en principe rester inchangées. Une fois le script modifié correctement, vous pouvez le lancer en tapant:
   ./mom4p1_coupled_compile.csh
 Suite à la compilation du code, un nouveau répertoire aura été créé portant le nom <tt>exec_$platform</tt>, dans lequel se trouve un répertoire <tt>$type</tt> (<tt>mom4p1_coupled</tt> si vous avez compilé avec <tt>mom4p1_coupled_compile.csh</tt>). C'est dans ce répertoire que se trouve l'exécutable <tt>fms_$type.x</tt> (e.g. <tt>fms_mom4p1_coupled.x</tt>) ainsi que les produits de la compilation (*.o et *.mod).

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(Aucune différence)

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 == Configurer une expérience ==
-Avant de configurer une expérience, il est commode de se créer un répertoire de travail distinct se trouvant sur une partition contenant suffisamment d'espace disque. Sur [[brandypot]], utilisez la partition <tt>/sas/usagers</tt>. Par exemple, vous pouvez créer le répertoire <tt>/sas/usagers/dumoda01/mom4p1/work</tt> dans lequel vous construirez et exécuterai toutes vos expériences numérique de MOM4p1. Une fois ce répertoire créé, faites un lien symbolique du répertoire racine de MOM4p1 vers celui-ci.
+Avant de configurer une expérience, il est commode de se créer un répertoire de travail distinct se trouvant sur une partition contenant suffisamment d'espace disque. Sur [[brandypot]], utilisez la partition <tt>/sas/usagers</tt>. Par exemple, vous pouvez créer le répertoire <tt>/sas/usagers/dumoda01/mom4p1/work</tt> dans lequel vous construirez et exécuterai toutes vos expériences numériques MOM4p1. Une fois ce répertoire créé, faites un lien symbolique du répertoire racine de MOM4p1 vers celui-ci:
   ln -s /sas/usagers/dumoda01/mom4p1/work /home/dumoda01/mom4p1/
-Vous êtes maintenant prêt à construire une expérience. Un bon point de départ pour cela est de suivre le guide démarrage rapide se trouvant dans <tt>doc/</tt>. Les prochaines sections rappellent les grandes lignes des différentes étapes en mettant l'emphase sur certains détails cruciaux.
+Vous êtes maintenant prêt à construire une expérience. Un bon point de départ pour cela est de suivre le guide démarrage rapide se trouvant dans <tt>doc/</tt>.
 === Générer une grille ===