Soumettre une tâche - Historique des versions

Caveenj : Caveenj a déplacé la page Soumettre une tÃ¢che vers Soumettre une tâche

2019-03-14T15:34:05Z

Caveenj a déplacé la page Soumettre une tÃ¢che vers Soumettre une tâche

Caveenj : /* Lancement de tâches en cascade */

2018-03-28T20:19:14Z

Lancement de tâches en cascade

Bandma01 : /* Lancement de tâches en cascade */

2018-03-28T20:07:06Z

Lancement de tâches en cascade

Bandma01 : /* Lancement de tâches en cascade */

2018-03-28T20:06:16Z

Lancement de tâches en cascade

Bandma01 : /* Lancement de tâches en cascade */

2018-03-28T20:05:40Z

Lancement de tâches en cascade

Bandma01 le 28 mars 2018 à 20:04

2018-03-28T20:04:33Z

Bandma01 le 28 mars 2018 à 20:02

2018-03-28T20:02:25Z

Bandma01 le 28 mars 2018 à 20:01

2018-03-28T20:01:34Z

Bandma01 le 28 mars 2018 à 19:42

2018-03-28T19:42:49Z

Caveenj : /* Lancement d’un programme avec MPI */

2017-12-07T20:34:07Z

Lancement d’un programme avec MPI

@@ Ligne 196 : / Ligne 196 : @@
 Quand des simulations prennent du temps,  il peut être intéressant d'écrire un petit programme qui lance les simulations l'une à la suite de l'autre. En PBS, on peut utiliser l'option "qsub -W depend=..." pour créer des dépendances entre les tâches à soumettre.
-;*<code> qsub -W depend=afterok:<Job-ID> <QSUB SCRIPT> </code>
+ qsub -W depend=afterok:<Job-ID> <QSUB SCRIPT>
-Les différentes options qui existent pour "depend=..." sont :
+Ici, le script  <QSUB SCRIPT> sera soumis après que la tâche, <Job-ID> aura été '''complétée avec succès''' .
-;*afterok:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine sans erreur ou est complétée avec succès.
-;*afternotok:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec une erreur
+Les différentes options qui existent pour "depend=..." sont:
-;*afterany:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec ou sans erreur
 Une méthode pour simplifier ce processus est d'écrire une séquence de script de lancement de tâche  job1.pbs, job2.pbs, job3.pbs etc et de les soumettre comme ceci:
-FIRST=$(qsub job1.pbs)
+ #!/bin/bash
 echo $FIRST
-SECOND=$(qsub -W depend=afterany:$FIRST job2.pbs)
+ FIRST=$(qsub job1.pbs)
-echo $SECOND
+ echo $FIRST
-THIRD=$(qsub -W depend=afterany:$SECOND job3.pbs)
+ SECOND=$(qsub -W depend=afterany:$FIRST job2.pbs)
-echo $THIRD
+ echo $SECOND
 La tâche  <$FIRST> sera placée dans la queue d''exécution  pendant que les autres tâches <$SECOND> et <$THIRD> seront placées dans la queue mais en attente avec un Hold ("H'').

@@ Ligne 199 : / Ligne 199 : @@
 : Ici, le script  <QSUB SCRIPT> sera soumis après que la tâche, <Job-ID> aura été '''complétée avec succès''' .
-Les différentes options qui existent pour "depend=..." sont:
+Les différentes options qui existent pour "depend=..." sont :
-;* afterok:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine sans erreur ou est complétée avec succès.
+;*afterok:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine sans erreur ou est complétée avec succès.
-;* afternotok:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec une erreur
+;*afternotok:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec une erreur
-;* afterany:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec ou sans erreur
+;*afterany:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec ou sans erreur

@@ Ligne 200 : / Ligne 200 : @@
 Les différentes options qui existent pour "depend=..." sont:
 ;* afterok:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine sans erreur ou est complétée avec succès.
-;*afterok:<Job-ID>  La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine sans erreur ou est complétée avec succès.
+;* afternotok:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec une erreur
-;*afternotok:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec une erreur
+;* afterany:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec ou sans erreur

@@ Ligne 200 : / Ligne 200 : @@
 Les différentes options qui existent pour "depend=..." sont:
 ;*afterok:<Job-ID>  La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine sans erreur ou est complétée avec succès.
 ;*afternotok:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec une erreur

@@ Ligne 200 : / Ligne 200 : @@
 Les différentes options qui existent pour "depend=..." sont:
--afterok:<Job-ID>  La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine sans erreur ou est complétée avec succès.
+;*afterok:<Job-ID>  La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine sans erreur ou est complétée avec succès.
--afternotok:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec une erreur
+;*afternotok:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec une erreur
--afterany:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec ou sans erreur
+;*afterany:<Job-ID> La prochaine tâche est exécutée si la tâche <Job-ID> se termine avec ou sans erreur
@@ Ligne 217 : / Ligne 217 : @@
 echo $THIRD
-La tâche  <$FIRST> sera placée dans la queue d'exécution  pendant que les autres tâches <$SECOND> et <$THIRD> seront placées dans la queue mais en attente avec un Hold ("H'').
+La tâche  <$FIRST> sera placée dans la queue d''exécution  pendant que les autres tâches <$SECOND> et <$THIRD> seront placées dans la queue mais en attente avec un Hold ("H'').
-Quand <$FIRST> sera complétée, <$SECOND> rejoindra la queue d'exécution active, pendant que <$THIRD> sera encore en attente.
+Quand <$FIRST> sera complétée, <$SECOND> rejoindra la queue d''exécution active, pendant que <$THIRD> sera encore en attente.
 Attention: si on liste les dépendances comme  "afterok"/"afternotok" et que la tâche se termine avec /sans erreurs, la tâche suivant sera tuée vue que la dépendance n'aura pas été validée.

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(Aucune différence)

@@ Ligne 195 : / Ligne 195 : @@
 Quand des simulations prennent du temps,  il peut être intéressant d'écrire un petit programme qui lance les simulations l'une à la suite de l'autre. En PBS, on peut utiliser l'option "qsub -W depend=..." pour créer des dépendances entre les tâches à soumettre.
 [[Category:Torque]]
 [[Category:PBS]]
 [[Category:Mingan]]

@@ Ligne 173 : / Ligne 173 : @@
 #Directives PBS
 #PBS -l walltime=20:00:00
 #PBS -l nodes=3:ppn=21