Lire NetCDF.F90
!*****ISMER-UQAR******************************************************** ! Code du modele ROM en developpement a ISMER-UQAR. ! Lasso ! ! Revision: $Id$ !***********************************************************************
subroutine lire_netcdf(ncid,varid,nt,nj,ni,nk,ki,kf,datanc)
! ! Modification: Simon Senneville - ISMER - 5 octobre 2010 ! Auteur: Simon Senneville - ISMER ! ! Objet: Lecture des fichiers NetCDF ! ! Parametres: ! intent(in): ncid ! Identificateur du fichier NetCDF ! intent(in): varid ! Identificateur de la variable voulue ! intent(in): nt ! dimension relative au temps ! intent(in): nj ! dimension relative a l'axe verticale ! intent(in): ni ! dimension relative a l'axe i ! intent(in): nk ! dimension relative a l'axe k ! intent(in): ki ! position initiale de sur l'axe KSTEP ! intent(in): kf ! position finale de sur l'axe KSTEP ! intent(out): datanc ! champs lu ! ! Retour: n/a ! [ex: 0 : succes] ! [ -1 : erreur] ! ! [note: ] ! :: ! !***********************************************************************
implicit none
! Data ditionary: declare variables type, definition and units ! type :: var_name ! definition, units ! [type,dimension([x,y]) :: var_name ! definition, units] ! [type,intent(in|out|inout]):: name ! definition, units] ...
integer,intent(in) :: nt, ni, nj, nk, ki, kf, varid, ncid
real,dimension(nt,nj,ni,nk),intent(out) :: datanc
real,dimension(nk,ni) :: datanc_no_comp
integer :: i, k
!-----------------------------------------------------------------------
integer :: idims, it, iw
integer :: ret, xtype, ndims, natts
integer :: id, wi2d, wi3d, dimw, iwid, indx, indy, indz, indice
integer :: dimx, dimy, dimz, dimt, stat, dimxy
integer :: xid, yid, zid, tid, tvid, ksvid, dtid, dimtid, dimwid
integer :: tread_ti, tread_tf
integer :: deltat_nc, dt_in,kstart, kstart_p1, dkstep
integer,dimension(2) :: indstart_cp, indcount_cp
integer,dimension(6) :: ncref ! Date de reference (ss,mm,hh,j,m,a)
real(kind=8) :: nct, ncstart, ncend, ncvalid
real,allocatable,dimension(:,:) :: data_wet
integer,allocatable,dimension(:) :: dimids
integer,allocatable,dimension(:) :: wet
character(len=80) :: nom
character(len=80),allocatable,dimension(:) :: dimnames
logical :: v2d, v3d, comp, vtd
! Including the NetCDF library for fortran
- include "netcdf.inc"
vtd = .FALSE. ! Initialisation de la semaphore vtd
ret = nf_inq_varndims(ncid,varid,ndims) ! Trouver le nombre de dimension de la variable TAG
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
allocate (dimids(ndims),dimnames(ndims),stat=stat) ! Allouer la dimension de dimids et dimnames
if (stat /= 0) then
write(*,*)'Erreur: allocate'
stop
end if
ret = nf_inq_var(ncid,varid,nom,xtype,ndims,dimids(1),natts) ! Lire les informaitons relatives a la variable varid
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
do idims = 1,ndims
ret = nf_inq_dimname(ncid,dimids(idims),nom) ! Lire de nom des dimensions
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
dimnames(idims) = nom(:)
if (trim(dimnames(idims))=='NVALID2D') then ! Verifier si c'est une variable 2D compressee
comp = .TRUE.
v2d = .TRUE.
ret = nf_inq_dimid(ncid,'NVALID2D',dimwid) ! Si oui, lire l'id de NVALID2D
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
ret = nf_inq_dimlen(ncid,dimwid,dimw) ! lire la dimension de NVALID2D
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
ret = nf_inq_varid(ncid,'INDEXVALID2D',iwid) ! lire l'id de INDEXVALID2D
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
end if
if (trim(dimnames(idims))=='NVALID3D') then ! Verifier si c'est une variable 3D compressee
comp = .TRUE.
v3d = .TRUE.
ret = nf_inq_dimid(ncid,'NVALID3D',dimwid) ! Si oui, lire l'id de NVALID3D
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
ret = nf_inq_dimlen(ncid,dimwid,dimw) ! lire la dimension de NVALID3D
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
ret = nf_inq_varid(ncid,'INDEXVALID3D',iwid) ! lire l'id de INDEXVALID3D
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
end if
if (trim(dimnames(idims))=='TROM') then ! Verifier si c'est une variable fonction de TROM
vtd = .TRUE.
ret = nf_inq_dimid(ncid,'TROM',tid) ! Si oui, lire l'id de TROM
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
ret = nf_inq_varid(ncid,'TROM',dimt) ! lire l'id variable TROM
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
end if
if (trim(dimnames(idims))=='KROM') then ! Non-compressee
comp = .FALSE.
end if
if (trim(dimnames(idims))=='IROM') then ! Non-compressee
comp = .FALSE.
end if
if (trim(dimnames(idims))=='ZROM') then ! Non-compressee
comp = .FALSE.
end if
end do
if (comp) then ! Si la variable est compressee, il faut la decompresse
allocate (wet(dimw),stat=stat) ! Alloue l'espace a l'axe de comrpession
if (stat/=0) then
write(*,*) 'Error with allocate of the variable: wet'
stop
end if
allocate (data_wet(dimw,nt),stat=stat) ! Alloue l'espace a la variable compressee
if (stat/=0) then
write(*,*) 'Error with allocate of the variable: data_wet'
stop
end if
ret = nf_get_var_int(ncid,iwid,wet) ! Lire la variable de l'axe de compression
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
!------------------------------
if (vtd) then ! Si la variable est en fonction de TROM
indstart_cp(1) = 1 ! Lire une ecriture
indstart_cp(2) = ki ! Le ki ieme element
indcount_cp(1) = dimw ! de dimw elements
indcount_cp(2) = nt ! pour nt pas de temps
ret = nf_get_vara_real(ncid,varid,indstart_cp(1),indcount_cp(1), data_wet(1,1)); ! Lire cette information dans data_wet
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
!------------------------------
else ! Si la variable est independante du temps
indstart_cp(1) = 1 ! Lire une ecriture
indstart_cp(2) = 1 ! Le ki ieme element
indcount_cp(1) = dimw ! de dimw elements
indcount_cp(2) = 1 ! pour nt pas de temps
ret = nf_get_vara_real(ncid,varid,indstart_cp(1),indcount_cp(1), data_wet(1,1)); ! Lire cette information dans data_wet
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
end if
!------------------------------
dimxy=ni*nk; ! Dimension horizontale
do it = 1 , nt ! Decompression du champs compressee
do iw = 1 , dimw
indice = wet(iw);
indz = (indice-1) / dimxy;
indice = indice-indz*dimxy;
indy = (indice-1) / nk;
indx = indice-indy*nk;
indy = indy + 1 ;
indz = indz + 1 ;
datanc(it,indz,indy,indx) = data_wet(iw,it); ! La variable decompresse est lu dans datanc
end do
end do
deallocate(wet,data_wet)
else ! Si la variable ne depend pas du temps
ret = nf_get_var_real(ncid,varid,datanc_no_comp) ! Lire cette information dans datanc directment
! nf_get_var_real lit les variable dans un ordre different (comme en C)
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
endif
forall (i=1:ni,k=1:nk) ! Transformation de (k,i) a (i,k)
datanc(1,1,i,k)=datanc_no_comp(k,i) ! A_FAIRE recoder cette partie afin qu'elle soit plus robuste
endforall
endif
ret = nf_close(ncid) ! Fermeture du fichier ncid ouvert par getdims
if (ret.ne.NF_NOERR) then
write(*,*) nf_strerror(ret)
stop
end if
deallocate(dimids,dimnames,stat=stat) ! Deallocation de l'espace memoire
if (stat /= 0) then
write(*,*)'Dans lire_netcdf Erreur: deallocate'
stop
end if
!------------------------------
end subroutine lire_netcdf