Différences entre versions de « Modules »
| Ligne 72 : | Ligne 72 : | ||
|opt-python | |opt-python | ||
|Charge Python version 2.7.6 ou 3.3 au lieu du Python par défaut qui est à la version 2.6.6 | |Charge Python version 2.7.6 ou 3.3 au lieu du Python par défaut qui est à la version 2.6.6 | ||
| + | |- | ||
| + | |netcdf/gcc-4.9.2 | ||
| + | |Bibliothèque NetCDF compilée avec gcc 4.9.2 (Requiert le module gcc/4.9.2) | ||
|- | |- | ||
|use.own | |use.own | ||
| Ligne 86 : | Ligne 89 : | ||
|- | |- | ||
|openmpi/1.8.3-gcc-4.9.2 | |openmpi/1.8.3-gcc-4.9.2 | ||
| − | |Charge la version 1.8.3 de openmpi compilée avec GCC version 4.9.2 et interaction avec TORQUE | + | |Charge la version 1.8.3 de openmpi compilée avec GCC version 4.9.2 et interaction avec TORQUE (Requiert le module gcc/4.9.2) |
|- | |- | ||
| − | | | + | |octave/3.8.2 |
| − | | | + | |Charge la version 3.8.2 d'Octave |
|- | |- | ||
|openmpi/1.8.3 | |openmpi/1.8.3 | ||
|Charge openmpi version 1.8.3 avec interraction avec TORQUE | |Charge openmpi version 1.8.3 avec interraction avec TORQUE | ||
| + | |- | ||
| + | |makedepf90 | ||
| + | |Rend disponible le générateur de dépendences pour Fortran 90 | ||
|- | |- | ||
|rom_nc_lib | |rom_nc_lib | ||
Version du 30 mars 2015 à 09:55
Introduction
L'application Environment Modules permet de modifier l'environnement d'un utilisateur afin qu'il puisse avoir accès à certaines fonctionnalités. Cet outil est commode lorsque plusieurs utilisateurs utilisent, par exemple, différentes versions d'un même logiciel, ou bien lorsque différents modèles requièrent différentes version d'un même compilateur.
Comment utiliser les modules
Par défaut module est initialisé pour tous les utilisateurs de Mingan via le fichier /etc/bashrc. La commande module avail permet de voir la liste des modules qui sont disponibles, i.e. qui ont été préalablement installés par l'administrateur. Sur Mingan, en date du 26 février 2015, on obtient:
$ module avail ---------------------- /usr/share/Modules/modulefiles ----------------------- dot modules rocks-openmpi module-git null rocks-openmpi_ib module-info opt-python use.own ----------------------------- /etc/modulefiles ------------------------------ openmpi-x86_64 ---------------------- /share/apps/modules/modulefiles ---------------------- gcc/4.9.2 mpich2 openmpi-1.8.3-gcc-4.9.2 makedepf90 openmpi/1.8.3 rom_nc_lib
Les modules peuvent être chargés ou déchargés avec les commandes module load ou module unload, respectivement. Pour voir quels modules sont chargés, utilisez la commande module list
$ module list No Modulefiles Currently Loaded.
Pour charger un module,
$ module load mpich2 $ module list Currently Loaded Modulefiles: 1) mpich2
Pour connaître les propriété d'un module,
$ module whatis dot dot: adds '.' to your PATH environment variable
ou encore,
$ module display dot ------------------------------------------------------------------- /usr/share/Modules/modulefiles/dot: module-whatis adds `.' to your PATH environment variable append-path PATH . -------------------------------------------------------------------
Description des modules
| Module | Description |
|---|---|
| dot | Ajoute le répertoire courant (./) à la variable PATH |
| modules | Charge l'environnement pour modules |
| rocks-openmpi | Utiliser OpenMPI compilé avec Rocks avec trasnport tcp |
| module-git | Obtenir les codes sources de la version courante de l'environnement module |
| null | Module qui ne fait absolument rien |
| rocks-openmpi_ib | Utiliser OpenMPI compilé avec Rocks avec trasnport ib (pas utilisable sur mingan) |
| module-info | retourne les informations et valeurs concernant le logiciel module |
| opt-python | Charge Python version 2.7.6 ou 3.3 au lieu du Python par défaut qui est à la version 2.6.6 |
| netcdf/gcc-4.9.2 | Bibliothèque NetCDF compilée avec gcc 4.9.2 (Requiert le module gcc/4.9.2) |
| use.own | Ajoute vos propres fichiers module à la variable MODULEPATH |
| openmpi-x86_64 | Version de openmpi compilée avec GCC 4.4 sans interaction avec TORQUE |
| gcc/4.9.2 | Charge la version 4.9.2 des compilateurs GNU |
| mpich2 | Charge l'environnement mpich2 |
| openmpi/1.8.3-gcc-4.9.2 | Charge la version 1.8.3 de openmpi compilée avec GCC version 4.9.2 et interaction avec TORQUE (Requiert le module gcc/4.9.2) |
| octave/3.8.2 | Charge la version 3.8.2 d'Octave |
| openmpi/1.8.3 | Charge openmpi version 1.8.3 avec interraction avec TORQUE |
| makedepf90 | Rend disponible le générateur de dépendences pour Fortran 90 |
| rom_nc_lib | Charge l'environnement permettant d'utiliser la bibliothèque rom_nc_lib pour les sorties netcdf du modèle MOR |